遗体去向
三大推测
而最令人不可思议的是，棺椁竟然不翼而飞，专家推断，棺椁里应该存放的是上官婉儿的遗体，也就意味遗体也不见了。那么是谁盗了这位才女呢?
专家推测：被家族株连毁墓
有专家认为，这有可能是上官婉儿的家族之后犯了什么大错，最后被掘了祖坟，连上官婉儿也没有放过。他举例说，唐初的徐懋功，唐初名将，与李靖并称，被封为英国公，为凌烟阁二十四功臣之一。早年随李世民平定四方，后来成为唐王朝开疆拓土的主要战将之一，曾破东突厥、高句丽，功勋卓著。然而后来，其孙子徐敬业“造反”，武则天一气之下，夺去李姓，免除爵位，把徐懋功从坟里挖出来，尸体烧掉，彻底挫骨扬灰。
文史推测：毁于“温韬之乱”
在唐末之后的五代时期，当时出现了一个给唐王陵带来了灾难性的人物五代节度使温韬，他趁乱几乎掘开了关中地区所有唐朝皇陵，当时在盗乾陵时风雨大作而没有得逞。在当时，是否还有其他重量级别的古墓被盗，目前也不得而知。
网友推测：根本未入墓中
网友“豆豉鱼”给出了一种最不靠谱的推测，史书记载公元710年，中宗突然死亡，政治敏感的上官婉儿联络了太平公主，此时的太平公主在朝堂中已是举足轻重，她也乐意与婉儿合作，于是二人连夜起草好了一份遗诏，遗诏的内容足以证明自己是和李唐宗室站在一起的。但是，李隆基深知其左右摇摆，此时若放过，定后悔无及，在韦氏一党尽数被杀后，将上官婉儿斩于剑下。当时会不会因为爱慕上官婉儿才华，而通过偷梁换柱的方式，没有杀她呢?其实，墓葬原本就是个空的。